HOME > 研究支援 > 分与可能なprimerのシーケンスとlist > COL9A3

COL9A3

COL9A3 PCR Primer
TargetPrimer nameSense primer (5'->3')Anti-sense primer (5'->3')Product size [bp]Annealing temperature[oC]
Exon1COL9A3-AF/ARCGCCCTTGCTAACTCACAGCAGCGAGGACCCATCGAG1284*
Exon2-3COL9A3-BF/BRTTGGGTCTCACCGAGGACGGCAGGATGAGACAGGATA1211*
Exon4-5COL9A3-CF/CRGCAAGCAGGACACACGAGGACACAGAGCAGCCAGAGGT1011*
Exon6-8COL9A3-DF/DRACTTGGACCCTGTTGTCCTGGAGGTCGGGTCTGGATCAT908*
Exon9COL9A3-QF/QRCTTCCCCTCTCCCTTTTCCTGGCCAAGTTAGGGTTAGGA400*
Exon10COL9A3-RF/RRACAGGATGAAGGGTCTCCAAGTGCAGGTCTAGACGGTGGT400*
Exon11COL9A3-FF/FRCGTCGACGTCCTGCTCTGTCAGCCTAAATCACCCAGCTC814*
Exon12COL9A3-E12F2/E12R2GCAGGCCTCACTTCAGTGTTGCAGCTGCTGTGCGGCAGCTTC154*
Exon13-14COL9A3-GF/GRAGCTGCTTGGGCTTGAGTAGGAGAACAGGGGCCCAGAG699*
Exon15COL9A3-HF/HRTAGAGGAAGGGCTGCTTGTGACATAAGGACCCAGGGAACC670*
Exon16COL9A3-SF/SRCTCCATGGTGTTAACTCTGTCCAATTGGGTTCTTCCACATAAGG151*
Exon17-19COL9A3-IF/IRCTGCCCACCATAGCTCCTTACTGAGCAGGCAGAAGCTG1214*
Exon20-22COL9A3-TF/TRAATGTAACTGGCAGCCCTGACCAATGGCTCAGTGCTAACC456*
Exon23-24COL9A3-KF/KRCTCCTGTGTCCACCCACTCTGGTGGGGGACTGTGGTACAT403*
Exon25-26COL9A3-LF/LRGGTGTTCACAGAAGCCCTTTTGCAGATTTTGACCCTGTCC1138*
Exon27-29COL9A3-MF/MRGCAGGTGTGTGGATGATTTGGCACGTTGGCTTCTGTGTAG793*
Exon30COL9A3-NF/NRACCCCAAAGCAGTTAAACCAACCAGAAGCAGCGCCTACTA410*
Exon31COL9A3-OF/ORGAAAAGCTGGCACCCTGTTGCTTTGCCAAGAGAAGAGGA299*
Exon32COL9A3-PF/PRAAGTCCCCCTGCTTTCAGTCAGGGCCTTTTGAGGTATGCT448*

*Unless otherwise noted, Roche Diagnostics GmbH Expand high Fidelity PCR System used denaturation at 95 oC for 30 sec annealing at 60 oC for 1 min extension at 72 oC for 1 min × 5 Cycles, and denaturatiion at 95 oC for 30 sec annealing at 55 oC for 1 min extention at 72 oC for 1 min × 35 Cycles.

COL9A3 Sequence Primer
TargetPrimer nameSequence
Exon1COL9A3-AR (Reverse)CAGCGAGGACCCATCGAG
Exon2COL9A3-2SR (Reverse)GGCCTGGTTTTCTCTCCATCAG
Exon3COL9A3-3SF (Forward)TCCTTCCAGTCTGTCCAGTTCAC
Exon4COL9A3-CSR (Reverse)TGGAGCCCAAGATGACTAAG
Exon5COL9A3-CSF (Forward)CTTGCTTGTCCAGGAATGAG
Exon6COL9A3-DF (Forward)ACTTGGACCCTGTTGTCCTG
Exon7COL9A3-DSF (Forward)CAGCCCTTCTTGTGCCTG
Exon8COL9A3-DR (Reverse)GAGGTCGGGTCTGGATCAT
Exon9COL9A3-QF (Forward)CTTCCCCTCTCCCTTTTCC
Exon10COL9A3-RF (Forward)ACAGGATGAAGGGTCTCCAA
Exon11COL9A3-FSR2 (Reverse)AGCACAGGGTGGTGCTTG
Exon12COL9A3-E12F2 (Forward)GCAGGCCTCACTTCAGTGTTGC
Exon13COL9A3-GF (Forward)AGCTGCTTGGGCTTGAGTAG
Exon14COL9A3-GR (Reverse)GAGAACAGGGGCCCAGAG
Exon15COL9A3-HF (Forward)TAGAGGAAGGGCTGCTTGTG
Exon16COL9A3-SF (Forward)CTCCATGGTGTTAACTCTGTCC
Exon16COL9A3-SR (Reverse)AATTGGGTTCTTCCACATAAGG
Exon17COL9A3-IF (Forward)CTGCCCACCATAGCTCCTT
Exon18COL9A3-IR (Reverse)ACTGAGCAGGCAGAAGCTG
Exon19COL9A3-IR (Reverse)ACTGAGCAGGCAGAAGCTG
Exon20COL9A3-TSR (Reverse)CTGCCCTGTAGAGGAAGGAG
Exon21COL9A3-TR (Reverse)CCAATGGCTCAGTGCTAACC
Exon22COL9A3-TR (Reverse)CCAATGGCTCAGTGCTAACC
Exon23COL9A3-KF (Forward)CTCCTGTGTCCACCCACTCT
Exon24COL9A3-KR (Reverse)GGTGGGGGACTGTGGTACAT
Exon25COL9A3-LF (Forward)GGTGTTCACAGAAGCCCTTT
Exon26COL9A3-LR (Reverse)TGCAGATTTTGACCCTGTCC
Exon27COL9A3-MSR (Reverse)CGTGATGCCAGGAACACC
Exon28COL9A3-MSR (Reverse)CGTGATGCCAGGAACACC
Exon28COL9A3-MSF (Forward)CACCTTCCTCTGTTCCTCTG
Exon29COL9A3-MSF (Forward)CACCTTCCTCTGTTCCTCTG
Exon30COL9A3-NF (Forward)ACCCCAAAGCAGTTAAACCA
Exon31COL9A3-OR (Reverse)GCTTTGCCAAGAGAAGAGGA
Exon32COL9A3-PF (Forward)AAGTCCCCCTGCTTTCAGTC
管理・運営:骨系統疾患コンソーシウム

連絡先

お問い合わせは、
遺伝子解析、DNA診断に関するもの:
山田(taka0197@kuhp.kyoto-u.ac.jp)宛

診断/X線診断に関するもの:
西村 (gen-n@pc4.so-net.ne.jp)宛
治療に関するもの:
池川(sikegawa@ims.u-tokyo.ac.jp)宛

でお願いします。なお、臨床像のファイルが5MB以上になる場合は、CDかファイルを分割して送ってください。